ตัวเร่งปฏิกิริยาหลักในกลไกการเร่งปฏิกิริยาในโปรตีเอสซีรีนคือ ตัวเร่งปฏิกิริยาสามตัวเร่งปฏิกิริยา ตัวเร่งปฏิกิริยาสามตัวคือชุดของกรดอะมิโนประสานกันสามตัว ที่สามารถพบได้ในสารออกฤทธิ์ ไซต์ของเอนไซม์บางชนิด Catalytic triads มักพบในเอนไซม์ hydrolase และ transferase (เช่น protease, amidases, esterases, acylases, lipases และ β-lactamases) https://en.wikipedia.org › wiki › Catalytic_triad
ตัวเร่งปฏิกิริยาสาม - Wikipedia
. … ซีรีนมีหมู่ -OH ที่สามารถทำหน้าที่เป็นนิวคลีโอไฟล์ โจมตีคาร์บอนิลคาร์บอนของพันธะเปปไทด์กรรไกรของซับสเตรต
สารยับยั้งซีรีนทำงานอย่างไร
สารยับยั้งซีรีนโปรตีเอสหรือเซอร์พิน ประกอบไปด้วยกลุ่มของโปรตีนที่ ต่อต้านการทำงานของโปรตีเอสซีรีน … ในกลไกนี้ เซอร์พินจะแสดงลำดับเปปไทด์ที่เลียนแบบซับสเตรต-ศูนย์รีแอกทีฟลูปไปยังโปรตีเอสซีรีนเป้าหมาย
ระบบรีเลย์ประจุมีหน้าที่อะไรในกลไกปฏิกิริยาโปรตีเอสซีรีน?
บทบาทของ Asp102 ในระบบการถ่ายทอดตัวเร่งปฏิกิริยาของโปรตีเอสซีรีนได้รับการศึกษาในทางทฤษฎีโดย การคำนวณโปรไฟล์พลังงานอิสระของซิงเกิ้ล ปฏิกิริยาการถ่ายโอนโปรตอนโดยทริปซินกลายพันธุ์ Asn102 และ ปฏิกิริยาการถ่ายโอนโปรตอนสองครั้งร่วมกัน (ที่เรียกว่ากลไกการถ่ายทอดประจุ) ของทริปซินประเภทไวด์
ข้อใดต่อไปนี้เป็นตัวอย่างของซีรีนโปรตีเอส
Chymotrypsin: >ใช้เป็นตัวอย่างของซีรีนโปรตีเอสเพราะเข้าใจโครงสร้างและกลไกเป็นอย่างดี
อะไรคือเหตุผลที่เรียกว่าซีรีนโปรตีเอส
พวกมันถูกเรียกว่าโปรตีเอสซีรีนด้วยเหตุผลสองประการ:
- พวกมันไฮโดรไลซ์โปรตีน
- พวกมันมี Ser ตกค้างในบริเวณที่ทำงานซึ่งมีความสำคัญต่อการเร่งปฏิกิริยา อันที่จริง Ser นี้มีปฏิกิริยามากกว่าซีรีนอื่นในโปรตีนมาก