ในอณูชีววิทยา STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) เป็นฐานข้อมูลทางชีววิทยาและทรัพยากรบนเว็บของปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีนที่ทราบและคาดการณ์ไว้ … เวอร์ชันล่าสุด 11b มีข้อมูลเกี่ยวกับ 24, 5 ล้านโปรตีนจากสิ่งมีชีวิตมากกว่า 5,000 ตัว
จุดประสงค์ของฐานข้อมูล STRING คืออะไร
ฐานข้อมูล STRING มีเป้าหมาย เพื่อรวบรวมและรวมข้อมูลนี้ โดยการรวมโปรตีนที่รู้จักและคาดการณ์ไว้–ข้อมูลการเชื่อมโยงโปรตีนสำหรับสิ่งมีชีวิตจำนวนมาก
คะแนน STRING คืออะไร
ใน STRING การโต้ตอบระหว่างโปรตีนกับโปรตีนแต่ละครั้งจะมี 'คะแนน' อย่างน้อยหนึ่งคะแนน ที่สำคัญ คะแนนเหล่านี้ไม่ได้บ่งบอกถึงความแข็งแกร่งหรือความจำเพาะของการโต้ตอบ แต่กลับเป็น เครื่องบ่งชี้ความมั่นใจ เช่น STRING มีแนวโน้มว่าจะตัดสินการโต้ตอบที่เป็นจริง ตามหลักฐานที่มีอยู่
ทำไมโปรตีนถึงโต้ตอบ
ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนกับโปรตีน (PPIs) คือ สัมผัสทางกายภาพของความจำเพาะสูงที่กำหนด ระหว่างโมเลกุลโปรตีนตั้งแต่สองโมเลกุลขึ้นไปอันเป็นผลมาจากเหตุการณ์ทางชีวเคมีที่นำโดยปฏิกิริยาที่มีแรงไฟฟ้าสถิต ไฮโดรเจน พันธะและเอฟเฟกต์ไม่ชอบน้ำ
การเชื่อมโยงการทำงานคืออะไร
คำจำกัดความ. ความสัมพันธ์แบบไบนารีระหว่างเอนทิตีทางชีววิทยา เมื่อหนึ่งในนั้นปรับเปลี่ยนอีกอันในแง่ของการทำงาน การแสดงออก ความเสื่อมหรือความเสถียรของอีกฝ่ายหนึ่งและความสัมพันธ์ไม่สามารถตรวจสอบระหว่างพันธมิตรได้โดยตรง ดังนั้นจึงมีขั้นตอนกลางโดยปริยาย