เจล Agarose ใช้กับ DNA เนื่องจากชีวโมเลกุลมีขนาดใหญ่กว่า (ชิ้นส่วน DNA มักจะเป็นพัน ๆ kDa) สำหรับเจลโปรตีน โพลีอะคริลาไมด์ให้ ความละเอียดที่ดี เนื่องจากขนาดที่เล็กกว่ามาก (50 kDa ปกติ) จะเหมาะสมกว่าสำหรับช่องว่างระหว่างโมเลกุลที่แน่นกว่าของเจล
ความแตกต่างระหว่างอะกาโรสเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสและโพลีอะคริลาไมด์เจลอิเล็กโทรโฟรีซิสต่างกันอย่างไร
ความแตกต่างหลักระหว่าง agarose และ polyacrylamide คือ agarose ใช้ใน agarose gel electrophoresis (AGE) เป็นหลักสำหรับการแยก DNA ในขณะที่ polyacrylamide ใช้ในเจล polyacrylamide อิเล็กโตรโฟรีซิส (PAGE) เป็นหลักสำหรับการแยกโปรตีน
ทำไมโพลีอะคริลาไมด์เจลถึงดีกว่าเจลอะกาโรส
เจลโพลีอะคริลาไมด์มีข้อดีเหนือกว่าเจลอากาโรสสามประการดังต่อไปนี้: (1) พลังในการละลายของพวกมันดีมากจนสามารถแยกโมเลกุลของ DNA ที่มีความยาวต่างกันเพียง 0.1% (เช่น 1 bp ใน 1,000 bp). (2) พวกมันสามารถรองรับ DNA ในปริมาณที่มากกว่าเจลอากาโรสได้มาก.
ทำไมจึงใช้โพลีอะคริลาไมด์แทน agarose เมื่อกำหนดลักษณะโปรตีน
โพลีอะคริลาไมด์และอะกาโรสเป็นเมทริกซ์สนับสนุนสองตัวที่ใช้กันทั่วไปในอิเล็กโตรโฟรีซิส … Agarose มีรูพรุนขนาดใหญ่และ เหมาะสำหรับการแยกกรดนิวคลีอิกและโปรตีนคอมเพล็กซ์ขนาดใหญ่ โพลิอะคริลาไมด์มีรูพรุนขนาดเล็กกว่าและเหมาะสำหรับการแยกโปรตีนส่วนใหญ่และกรดนิวคลีอิกที่มีขนาดเล็กลง
ทำไมจึงใช้เจลโพลีอะคริลาไมด์
โพลีอะคริลาไมด์เจลอิเล็กโตรโฟรีซิส (PAGE) คือ ใช้สำหรับการวิเคราะห์โปรตีนเป็นประจำ และยังสามารถใช้เพื่อแยกชิ้นส่วนกรดนิวคลีอิกที่มีขนาดเล็กกว่า 100 bp กรดนิวคลีอิกมักจะวิเคราะห์โดยใช้ระบบบัฟเฟอร์แบบต่อเนื่องซึ่งมีองค์ประกอบบัฟเฟอร์คงที่ pH และขนาดรูพรุนตลอดทั้งเจล