ใช้ระเบิดตอนไหน?

2024 ผู้เขียน: Elizabeth Oswald | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2024-01-13 00:13

BLAST ใช้งานได้หลากหลาย ซึ่งรวมถึง ระบุสายพันธุ์ ระบุโดเมน ก่อตั้งสายวิวัฒนาการ จับคู่ DNA และเปรียบเทียบ ด้วยการใช้ BLAST คุณสามารถระบุสายพันธุ์หรือค้นหาสายพันธุ์ที่คล้ายคลึงกันได้อย่างถูกต้อง

BLAST ใช้ทำอะไร

BLAST คืออัลกอริธึมของคอมพิวเตอร์ที่พร้อมใช้งานออนไลน์ที่เว็บไซต์ National Center for Biotechnology Information (NCBI) รวมถึงเว็บไซต์อื่นๆ อีกมากมาย BLAST สามารถ จัดตำแหน่งอย่างรวดเร็วและเปรียบเทียบลำดับ DNA ของแบบสอบถามกับฐานข้อมูลของลำดับ ซึ่งทำให้เป็นเครื่องมือสำคัญในการวิจัยจีโนมอย่างต่อเนื่อง

เทคนิค BLAST คืออะไร

เทคนิค BLAST คือ วิธีการแก้ไขข้อร้องเรียนที่พัฒนาโดย Albert Barneto ตัวช่วยจำย่อมาจาก Believe, Listen, Apologize, Satisfy, and Thank (ตารางที่ 1) ^{6. บทความนี้อธิบายประโยชน์ในการดูแลผู้ป่วยและเป็นเครื่องมือการสอนทางคลินิก}

BLAST ทำงานอย่างไรกับ DNA

BLAST ทำงานอย่างไร? BLAST ระบุลำดับที่คล้ายคลึงกันโดยใช้วิธีฮิวริสติก ซึ่งในขั้นต้นจะค้นหาการจับคู่แบบสั้นระหว่างสองลำดับ ดังนั้นวิธีการนี้จึงไม่คำนึงถึงพื้นที่ของลำดับทั้งหมด หลังจากการจับคู่ครั้งแรก BLAST จะพยายามเริ่มต้นการจัดตำแหน่งในพื้นที่จากการจับคู่เริ่มต้นเหล่านี้

ทำไม BLAST ถึงเร็วกว่า Fasta

ในแง่ของความซับซ้อนรันไทม์ของอัลกอริทึม BLAST นั้นเร็วกว่า FASTA โดยการค้นหาเฉพาะรูปแบบที่สำคัญกว่าในลำดับ. ความไว (หรือความแม่นยำ) ของ BLAST และ FASTA มีแนวโน้มที่จะแตกต่างกันสำหรับลำดับกรดนิวคลีอิกและโปรตีน (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml)