Proline มักพบที่ส่วนท้ายของ α helix หรือในทางกลับกันหรือลูป ซึ่งแตกต่างจากกรดอะมิโนอื่น ๆ ที่มีอยู่เกือบทั้งหมดในทรานส์ฟอร์มในโพลีเปปไทด์ Proline สามารถมีอยู่ในการกำหนดค่า cis ในเปปไทด์
อัลฟาเฮลิซมีโพรลีนตกค้างหรือไม่
ตอนนี้มีโครงสร้างโปรตีนมากกว่า 30,000 โครงสร้างในธนาคารข้อมูลโปรตีน เป็นที่ชัดเจนว่า โพรลีนตกค้างอยู่ใน α-helices ซึ่งพวกมันมักจะมีบทบาทสำคัญ ในโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน
กรดอะมิโนอะไรอยู่ในอัลฟาเฮลิซ
กรดอะมิโนทั้ง 20 ชนิดสามารถมีส่วนร่วมใน α-helix ได้ แต่บางชนิดก็มีประโยชน์มากกว่าตัวอื่นๆ Ala, Glu, Leu และ Met มักพบในเฮลิซ ในขณะที่ Gly, Tyr, Ser และ Pro มีโอกาสน้อยที่จะเห็น
เบตาชีตมีโพรลีนหรือไม่
Proline ไม่ได้รับการสนับสนุนในโครงสร้างเบต้าชีต เนื่องจากไม่สามารถทำให้เครือข่ายพันธะ H สมบูรณ์ได้ เมื่อโพรลีนเกิดขึ้นในแผ่น อาจมีส่วนนูนหรือขอบแผ่นที่ขาดตัวให้พันธะอะมิโนไฮโดรเจนไม่สำคัญ
อัลฟ่าเฮลิซมีอะไรบ้าง
เกลียวอัลฟ่า (α-helix) เป็นมาตรฐานทั่วไปใน โครงสร้างรองของโปรตีน และเป็นรูปเกลียวขวามือซึ่งกระดูกสันหลังทุกกลุ่ม N−H กลุ่มไฮโดรเจน ยึดติดกับกระดูกสันหลัง C=O กลุ่มของกรดอะมิโนพบสารตกค้างสี่ตัวก่อนหน้าตามลำดับโปรตีน