โดยปกติ ซีรีนและทรีโอนีน ฟอสโฟไซต์จะถูกกลายพันธุ์เป็นอะลานีน (หรือวาลีนสำหรับทรีโอนีน) และไซต์ฟอสโฟรีเลชันของไทโรซีนจะถูกกลายพันธุ์เป็นฟีนิลอะลานีน เนื่องจากแมสสเปกโตรเมทรีอาจพลาดไซต์ต่างๆ สิ่งสำคัญคือต้องตรวจสอบว่าไซต์หลักหรือทั้งหมดได้รับการระบุและกลายพันธุ์แล้ว
กรดอะมิโนชนิดใดที่สามารถฟอสโฟรีเลตได้
ฟอสฟอรีเลชั่นพบมากที่สุดใน ซีรีนและทรีโอนีน กรดอะมิโนตกค้างในโปรตีน แต่ก็เกิดขึ้นกับไทโรซีนและกรดอะมิโนอื่นๆ ที่ตกค้าง (ฮิสติดีน กรดแอสปาร์ติก กรดกลูตามิก) เช่นกัน
อะลานีนได้รับฟอสโฟรีเลตหรือไม่
ซีรีนมักจะกลายพันธุ์เป็นกรดกลูตามิก (บางครั้งเป็นกรดแอสปาร์ติก) เพื่อเลียนแบบฟอสโฟรีเลชันของซีรีนที่ตกค้าง ในทางกลับกัน การกลายพันธุ์ซีรีนเป็น อะลานีนจะป้องกันฟอสโฟรีเลชั่นที่อาจเกิดขึ้นได้ … ฟอสฟอรีเลชั่นเกิดขึ้นหลังจากที่โปรตีนพับเก็บในรูปแบบที่ถูกต้อง
เอ็นไซม์ชนิดใดที่สามารถฟอสโฟรีเลตได้
โปรตีนฟอสโฟรีเลชั่นเป็น PTM แบบย้อนกลับที่อาศัยโดย kinases และ phosphatase ซึ่งเป็นสารตั้งต้นของฟอสโฟรีเลตและดีฟอสโฟรีเลตตามลำดับ เอนไซม์สองตระกูลนี้เอื้อต่อธรรมชาติแบบไดนามิกของโปรตีนฟอสโฟรีเลตในเซลล์
เปปไทด์เป็นฟอสโฟรีเลตได้ไหม
เปปไทด์ฟอสโฟรีเลชั่นเป็นเปปไทด์ที่มีฟอสเฟต (PO43-) กลุ่มเป็น เปปไทด์ที่มีซีรีน ทรีโอนีนหรือไทโรซีน …โปรตีนฟอสโฟรีเลชั่นสามารถเกิดขึ้นได้กับกรดอะมิโนหลายชนิด ฟอสฟอริเลชันบนซีรีนพบได้บ่อยที่สุด รองลงมาคือทรีโอนีน