ในทางตรงกันข้าม ลิเกส DNA ของยูคาริโอตส่วนใหญ่ ร่วมกับเอ็นไซม์ archaeal และ bacteriophage จะจัดอยู่ในวงศ์ย่อยที่สอง เอนไซม์เหล่านี้ ใช้ ATP เป็นโคแฟคเตอร์.
ligases ต้องการ ATP หรือไม่
มักใช้ DNA ligase สองตัว … T4 ligase ต้องการ ATP ในขณะที่ E. coli ligase ต้องการ NAD+ (Nicotinamide adenine dinucleotide เป็นโคเอ็นไซม์ที่ประกอบด้วย 2 nt เข้าร่วมผ่านกลุ่มฟอสเฟตของพวกมัน). ทั้งสองกระตุ้นการรวมกลุ่มของ 5′-ฟอสเฟตและกลุ่ม 3′-OH เพื่อสร้างพันธะฟอสโฟไดสเตอร์
ทำไมไลกาสถึงต้องการ ATP
สองขั้นตอนของปฏิกิริยา DNA ligation
ปฏิกิริยา DNA ligation นั้นมีขั้นตอนพื้นฐานสองขั้นตอน อย่างแรกเลย ปลาย DNA ต้องชนกันโดยบังเอิญและอยู่ด้วยกันนานพอที่ ligase จะเข้าร่วมกับพวกมัน … เพื่อให้เอนไซม์ทำปฏิกิริยาเพิ่มเติม AMP ในบริเวณที่ทำงานของเอนไซม์จะต้องถูกเติมโดย ATP
หน้าที่ของ ligases คืออะไร
DNA ligases มีบทบาทสำคัญใน รักษาความสมบูรณ์ของจีโนมโดยเข้าร่วมการแตกตัวในกระดูกสันหลังของ phosphodiester ของ DNA ที่เกิดขึ้นระหว่างการจำลองแบบและการรวมตัวใหม่ และเป็นผลมาจากความเสียหายของ DNA และ ซ่อมแซม. ยีนมนุษย์สามยีน LIG1, LIG3 และ LIG4 เข้ารหัส DNA ligase ที่ขึ้นกับ ATP
ไลกาสทำงานอย่างแข็งขันหรือเฉยเมย
DNA ligase ทำงานในระหว่างการจำลองแบบ กระบวนการซ่อมแซมและการรวมตัวใหม่ของ DNA มีการใช้กันอย่างแพร่หลายในการซ่อมแซมเส้นใยเดี่ยวทำลาย DNA ดูเพล็กซ์ของสิ่งมีชีวิตโดยใช้เกลียวคู่เป็นแม่แบบ ในขณะที่บางรูปแบบอาจซ่อมแซมความเสียหายของเกลียวคู่โดยเฉพาะ