DNA มีประจุลบ ดังนั้น เมื่อกระแสไฟฟ้าถูกนำไปใช้กับเจล DNA จะเคลื่อนไปยังขั้วไฟฟ้าที่มีประจุบวก DNA เส้นที่สั้นกว่า เคลื่อนผ่านเจลได้เร็วกว่าสายที่ยาวกว่า ส่งผลให้ชิ้นส่วนถูกจัดเรียงตามขนาด
ชิ้นส่วนไหนเคลื่อนที่เร็วที่สุด
เนื่องจากชิ้นส่วน DNA ทั้งหมดมีประจุต่อมวลเท่ากัน ชิ้นส่วนเล็ก จะเคลื่อนที่ผ่านเจลได้เร็วกว่าก้อนใหญ่
ทำไม DNA สายที่สั้นกว่าจึงเคลื่อนที่เร็วขึ้น
DNA ที่สั้นลง ค้นหารูขุมขนเพิ่มเติมที่พวกมันสามารถเลื้อยผ่านได้ ส่วน DNA ที่ยาวขึ้นจำเป็นต้องบีบและขยับขึ้นหรือลงมากขึ้น ด้วยเหตุนี้ ส่วน DNA ที่สั้นกว่าจะเคลื่อนผ่านเลนด้วยอัตราที่เร็วกว่าส่วน DNA ที่ยาวกว่า
ทำไมชิ้นส่วน DNA ที่สั้นกว่าจึงเดินทางได้ไกลที่สุด
[1] โมเลกุลของกรดนิวคลีอิกแยกออกจากกันโดยใช้สนามไฟฟ้าเพื่อเคลื่อนโมเลกุลที่มีประจุลบผ่านเมทริกซ์ agarose โมเลกุลที่สั้นกว่าจะเคลื่อนที่เร็วกว่าและเคลื่อนตัวได้ไกลกว่าโมเลกุลที่ยาวกว่า เพราะโมเลกุลที่สั้นกว่าจะเคลื่อนตัวผ่านรูขุมของเจลได้ง่ายขึ้น.
ทำไม DNA supercoiled ทำงานเร็วขึ้น
ในร่างกาย พลาสมิด DNA เป็นวงกลมที่มีขดลวดยวดยิ่งแน่นหนาเพื่อให้เข้ากับเซลล์ได้ … ดังนั้น สำหรับ DNA แบบขดลวดขนาดใหญ่ที่เท่ากัน วิ่งเร็วกว่า DNA แบบวงรอบ DNA เชิงเส้นไหลผ่านปลายเจลก่อน ดังนั้นจึงมีแรงเสียดทานน้อยกว่าเปิด-DNA ทรงกลม แต่มากกว่า supercoiled